ในแต่ละปี บัณฑิตวิทยาลัยจะสนับสนุนเงินทุนการศึกษา ทุนวิจัย ทุนวิทยานิพนธ์ ทุนไปเสนอผลงานวิจัยทั้งในและต่างประเทศ ตลอดจนรางวัลสำหรับการศึกษา และผลงานวิจัยเป็นจำนวนมาก โดยจัดสรรให้กับนักศึกษาทุกสาขาวิชา ทุกหลักสูตรที่อยู่ภายใต้การดูแลและประสานงานโดยบัณฑิตวิทยาลัย อีกทั้ง พร้อมที่จะ ช่วยเหลือสนับสนุนนักศึกษาในการแสวงหาแหล่งทุนต่างๆ

นอกจากนี้ หลักสูตร/คณะ/สถาบัน/วิทยาลัยต่างๆ ของมหาวิทยาลัยมหิดล ยังได้ร่วมสนับสนุนทุนประภทต่างๆให้กับนักศึกษาที่เข้าศึกษาในสังกัดด้วย